Le balbuzard pêcheur est l'un des rares rapaces répartis sur tous les continents, sauf l'Antarctique. Il occupe les régions boréales et tempérées de l'hémisphère nord, l'Amérique latine, le sud-est asiatique et les côtes de l'Australie. En Europe, on rencontre l'oiseau principalement en Scandinavie et en Ecosse. En France, l'espèce est essentiellement représentée par sa sous population méditerranéenne présente en Corse. Celle-ci hiverne dans le sud du bassin méditerranéen à l'exception de quelques individus qui demeurent en Corse.
Sa réputation de pilleur d'étangs a valu au balbuzard pêcheur une longue persécution. La loi du 7 mai 1883 l'ayant classé en "gibier nuisible", une prime était attribuée par tête abattue, en 1970 il ne restait plus que 4 couples en Corse. A la suite des mesures de protection prises sur l'hexagone, la population du balbuzard pêcheur est actuellement en progression. De la même façon, la mise en protection du site de Scandola a permis de restaurer la population de balbuzards pêcheurs notamment grâce à la mise en œuvre d'actions de gestion dont la construction de nids artificiels réalisée par les équipes du PNRC et plus récemment par la mise en place de zones de quiétude.
La conservation de cette espèce sur le long terme est liée à la mise en œuvre d'une gestion durable des activités humaines, en forte croissance sur ce secteur depuis quelques dizaines d'années. Près de 50 années de protection du site remarquable de Scandola amènent des évolutions notables tant du point de vue des ressources marines que de la conservation des espèces et des milieux. Cela conduit tout naturellement le Parc à souhaiter étendre cette action positive à un territoire plus vaste : Un projet d'extension de la Réserve Naturelle de Scandola est donc à l'étude.